Ответ
Протофайлы (.proto) обычно хранятся в репозитории проекта, часто в отдельной директории, например proto/ или api/. Они могут быть частью монорепозитория или выделены в отдельный репозиторий для общего доступа между сервисами.
Пример структуры:
project/
├── proto/
│ ├── service.proto
│ └── messages.proto
├── go.mod
└── main.goДля работы с ними в Go используется protoc (компилятор Protocol Buffers) и плагины, например protoc-gen-go. Сгенерированный код (.pb.go) обычно не хранится в репозитории, а создается при сборке.