Сталкивался ли с мельканием элемента при использовании селектора hover

Да, сталкивался. Это частая проблема, когда при наведении элемент резко появляется/исчезает. Основные причины и решения:

1. transition - добавляем плавность:

.element {
  opacity: 0;
  transition: opacity 0.3s ease;
}
.element:hover {
  opacity: 1;
}

2. backface-visibility - помогает в некоторых случаях:

.element {
  backface-visibility: hidden;
}

3. will-change - подсказка браузеру для оптимизации:

.element {
  will-change: transform, opacity;
}

Чаще всего помогает простое добавление transition. Проблема особенно заметна на сложных анимациях или слабых устройствах.