Сравнивает ли Манна-Уитни медианы

Нет, U-критерий Манна-Уитни сравнивает не медианы, а распределения в целом. Он проверяет гипотезу о том, что одна выборка «стохастически больше» другой (чаще принимает большие значения).

Разница в медианах — частный случай, но тест чувствителен и к другим различиям: форме распределения, дисперсии и т.д.

Пример в Python:

from scipy.stats import mannwhitneyu

sample1 = [10, 12, 15, 20, 25]
sample2 = [5, 8, 9, 18, 30]
stat, p_value = mannwhitneyu(sample1, sample2, alternative='two-sided')
print(f"p-value: {p_value:.3f}")

Если p-value < 0.05, распределения различаются значимо. Для сравнения именно медиан лучше использовать тест медиан или доверительные интервалы.